Раковицкое кладбище было основано в 1803 году. Территорию в 10 акров купили монахи из ордена кармелитов для организации кладбища в связи с запретом захоронения на кладбищах при костёлах, располагавшихся в пределах Кракова. Стоимость обустройства была оплачена муниципалитетом Кракова и близлежащих деревень. Первые похороны состоялись в январе 1803 года.

Раковицкое кладбище неоднократно расширялось. В 1836 году кармелиты докупили ещё 10 гектаров. В 1840 году кладбище было обнесено стеной. В 1863 году краковский муниципалитет выкупил землю у кармелитов и присоединил к кладбищу 5 гектаров, чтобы хоронить на новом участке жертвы эпидемии. Дальнейшее расширении произошло в 1866 году. На рубеже 1933 и 1934 годов кладбище расширилось к северу.

В 1976 году кладбище было внесено в реестр памятников культуры Малопольского воеводства.